Mathieu Rigouste mène des recherches critiques en sciences sociales tout en participant aux luttes contemporaines. Il est l'auteur de plusieurs ouvrages sur le système sécuritaire dont
L'Ennemi intérieur. La généalogie coloniale et militaire de l'ordre sécuritaire dans la France contemporaine (La Découverte, 2009) – tiré de sa thèse de socio-histoire – ,
La domination policière (La Fabrique, réédition 2021) et
Un seul héros le peuple. La contre-insurrection mise en échec par les soulèvements algériens de décembre 1960 (PMN Editions, 2020).